윤 교수는 한국식물학회가 발행하는 'Journal of Plant Biology' 논문을 SCI(E) 저널에 가장 많이 인용한 교신 저자이며 2019~2020년 제35대 한국식물학회 회장으로 재임하는 등 학술발전에 크게 기여한 공로를 인정받아 수상의 영예를 얻었다.

윤 교수는 식물생명공학 분야를 선도하는 연구자로 Cell, Nature Genetics, PNAS 등 국제 저명 학술지에 총 242편의 논문을 발표했으며, 특히 식물이 외부환경에 노출되었을 때 어떻게 신호를 활성화하고 둔감화 반응을 통해 생체방어 작용을 수행하는지에 대한 전과정을 분자수준에서 규명함으로써 미래 식량문제 해결을 위한 단초를 제공했다.

윤 교수는 세계 수준의 연구중심대학(WCU) 사업단장, BK21플러스 사업단장, 글로벌 연구실사업단장, 한국연구재단 전문위원, 한국식물학회 회장 등을 역임해 국내의 식물 생명 과학 분야의 발전에 기여했다.